Nowości

Naukowcy z Wielkiej Brytanii i Tajlandii wykorzystują procesory graficzne NVIDIA Tesla w walce z przyszłymi epidemiami wirusa H1N1
Wysokowydajny klaster procesorów graficznych służy do identyfikacji ciągów umożliwiających walkę z odpornymi na leki mutacjami wirusa H1N1

Product PR
Igor Stanek
Product PR Manager Notebooks/ION
EMEAI
NVIDIA Ltd
istanek@nvidia.com
+44 7775 940868
+42 0602 135136

Ewa Rudkowska / Kasia Kaplon
Tabasco s.c. (NVIDIA PR)
tabasco@tabasco.pl
+48 (71) 3632947
+48 (71) 3632223

Tamiflu (prawy górny róg) zbliża się do aktywnego rejonu neuraminidazy, enzymu grypy (lewy dolny róg). (Dzięki uprzejmości Uniwersytetu w Bristolu)
Tamiflu (prawy górny róg) zbliża się do aktywnego rejonu neuraminidazy, enzymu grypy (lewy dolny róg). (Dzięki uprzejmości Uniwersytetu w Bristolu)

HAMBURG, Niemcy—ISC’12—18 czerwca 2012 r.—Firma NVIDIA poinformowała dziś, że jej procesory graficzne odgrywają ważną rolę w badaniach zmierzających do odkrycia nowych sposobów na zapobiegnięcie przyszłych epidemii śmiertelnego wirusa grypy H1N1.

Walka z wirusem H1N1 jest problematyczna ze względu na jego częste i szybkie mutacje, które zmniejszają efektywność leków przeciwgrypowych, w tym Tamiflu® (oseltamiwir) czy Relenza® (zanamiwir).

Naukowcy z Uniwersytetu w Bristolu w Wielkiej Brytanii oraz uniwersytetów Bansomdejchaopraya Rajabhat i Chulalongkorn w Bangkoku zastosowali symulacje komputerowe w celu zobrazowania zmian w dynamice struktury chemicznej i biologicznej wirusa H1N1 spowodowanych mutacjami, pomyślnie tworząc pierwszy obraz wirusowego mechanizmu odporności na istniejące leki przeciwgrypowe. Ten przełom umożliwi wypracowanie nowych sposobów szybkiej produkcji leków do walki z tymi mutacjami, a także prawdopodobnie zmniejszy niebezpieczeństwo przyszłych epidemii.

Zespół naukowców odkrył mechanizm odpornościowy wirusa H1N1, wykorzystując niewielki klaster wyposażony w wysokowydajne procesory graficzne NVIDIA® Tesla® oraz oprogramowanie do obliczeń dynamiki molekularnej AMBER,w czasie o połowę krótszym i przy użyciu jedynie jednej piątej serwerów niż miałoby to miejsce w przypadku klastera opartego wyłącznie na procesorach centralnych.(1)

Dokument szczegółowo opisujący odkrycia naukowców został opublikowany w najnowszym wydaniu pisma Biochemistry.

„Czterowęzłowy klaster z ośmioma procesorami graficznymi pozwolił nam na przeprowadzenie i powtórzenie znacznie większej liczby złożonych symulacji w porównaniu ze standardowymi rozwiązaniami”, powiedział doktor Christopher Woods, kierownik zespołu badawczego z Wielkiej Brytanii. „Dzięki temu mogliśmy dokładnie zbadać wszystkie interesujące nas mutacje wirusa i stworzyć szczegółowy obraz, który pozwolił nam na szybką identyfikację głównych etapów mechanizmu tworzenia się odporności wirusa. Jeśli nasz system byłby wyposażony wyłącznie w procesory centralne i zawierałby od 16 do 24 procesorów, to zadanie zajęłoby przynajmniej dwa razy więcej czasu. Poza tym nie mielibyśmy klastra do wyłącznej dyspozycji, ponieważ wielu badaczy uniwersyteckich również potrzebuje mocy obliczeniowej.

Po epidemii grypy H1H1, która w 2009 r. zaraziła prawie 89 milionów osób, z czego 18300 ze skutkiem śmiertelnym(2), naukowcy nieustannie szukają przyczyny mutacji wirusów prowadzących do zwiększenia ich odporności na leki. Badania bakterii i wirusów są trudne, ponieważ reakcje między nimi zachodzą zbyt szybko i są zbyt delikatne, co uniemożliwia ich uchwycenie. Ponadto naukowcy mieli do tej pory dość ograniczony dostęp do zaawansowanych symulacji komputerowych takich układów, ponieważ wymagały one drogich i wysokowydajnych superkomputerów.

„Do niedawna przydatność symulacji komputerowych układów biologicznych w badaniach nad lekami i zapobieganiem chorób była niewielka, ponieważ wymagały one dużych i drogich superkomputerów”, powiedział Sumit Gupta, dyrektor ds. produktów Tesla w firmie NVIDIA. „Obecnie możemy stosować niewielkie i niedrogie serwery wyposażone w procesory graficzne, które zapewniają wysoką wydajność niezbędną do prowadzenia badań naukowych”.

Firma NVIDIA stworzyła program „jazdy próbnej” — GPU Test Drive, dzięki któremu naukowcy mogą osobiście doświadczyć korzyści, jakie zapewni im moc procesorów graficznych. W ramach tego programu chemicy i biolodzy obliczeniowi otrzymują bezpłatny dostęp do zdalnie hostowanego klastra procesorów graficznych, który umożliwia uruchomienie symulacji dynamiki molekularnej na procesorze graficznym. Osoby chcące uzyskać więcej informacji lub zgłosić chęć udziału zapraszamy na strone internetową GPU Test Drive.

O procesorach graficznych NVIDIA Tesla
Procesory graficzne Tesla to akceleratory oparte na platformie NVIDIA CUDA®, przeznaczone do obliczeń równoległych. Układy Tesla zostały zaprojektowane od podstaw z myślą o obliczeniach wielkoskalowych oraz badań obliczeniowych i superkomputerach, zapewniając znacząco wyższy poziom akceleracji w wielu aplikacjach naukowych i komercyjnych od rozwiązań opartych na samych procesorach centralnych.

Więcej informacji na temat procesorów graficznych NVIDIA Tesla można przeczytać na witrynie internetowej Tesla.Aby dowiedzieć się więcej o platformie CUDA lub pobrać najnowszą wersję, odwiedź stronę internetową CUDA.Informacje o firmie NVIDIA i jej produktach, materiały wideo, zdjęcia, itp., dostępne są w biurze prasowym NVIDIA.Można także śledzić nas na Twitterze (@NVIDIATesla).

O firmie NVIDIA
NVIDIA (NASDAQ: NVDA) uświadomiła światu moc i znaczenie grafiki komputerowej, konstruując w 1999 roku układ GPU. Obecnie jej procesory stosowane są w szerokim zakresie urządzeń od smartfonów, aż po superkomputery. Procesory mobilne NVIDIA wykorzystywane są w telefonach komórkowych, tabletach i systemach informacyjno-rozrywkowych w motoryzacji. Gracze PC polegają na układach GPU, ciesząc się możliwością obcowania ze światami oferującymi spektakularne i porywające wrażenia. Profesjonaliści wykorzystują je do tworzenia grafiki 3D i efektów wizualnych w filmach oraz projektowania wszystkiego od kijów golfowych, aż po samoloty odrzutowe Jumbo Jet. Natomiast badacze stosują układy GPU, aby przesuwać granice nauki dzięki obliczeniom o wysokiej wydajności. Firma posiada ponad 5000 ogólnoświatowych patentów, włączając te dotyczące fundamentalnych kwestii nowoczesnych technologii obliczeniowych. W celu uzyskania dodatkowych informacji, odwiedź stronę www.nvidia.pl.

Pewne oświadczenia przedstawione w tej informacji prasowej, w tym w tym wpływ i korzyści wynikające z zastosowania procesorów graficznych NVIDIA Tesla oraz wpływy patentów firmy na nowoczesne komputery są oświadczeniami wybiegającymi w przyszłość i jako takie są obciążone ryzykiem i niepewnością, przez co stan faktyczny może znacząco różnić się od oczekiwań. Czynnikami mogącymi spowodować istotne zmiany przedstawionych wyników są m.in. globalna sytuacja ekonomiczna; wpływ zewnętrznych dostawców produkujących, montujących, pakujących i testujących produkty firmy NVIDIA; wpływ postępu technologicznego i konkurencji; odbiór produktów firmy NVIDIA i produktów jej partnerów przez rynek; wady konstrukcyjne, produkcyjne lub programowe; zmiany w zainteresowaniach i potrzebach klientów; zmiany standardów i interfejsów branżowych; nieoczekiwana utrata wydajności produktów lub technologii po zintegrowaniu ich w systemach; oraz inne czynniki ryzyka wyszczególniane w pewnych okresach czasu w raportach firmy NVIDIA przesyłanych do Securities and Exchange Commission (Komisja Papierów Wartościowych i Giełd), w tym w dokumencie Form 10-Q za okres finansowy zakończony 29 kwietnia 2012 r. Kopie dokumentów dostarczonych Komisji są dostępne bezpłatnie, w niezmienionej formie, na stronie internetowej firmy NVIDIA. Te wybiegające w przyszłość oświadczenia obowiązują tylko w chwili ich opublikowania, a z wyjątkiem przypadków przewidzianych przez prawo, firma NVIDIA nie podejmuje żadnych zobowiązań dotyczących aktualizacji tych wybiegających w przyszłość oświadczeń.

###

© 2012 NVIDIA Corporation. Wszelkie prawa zastrzeżone. NVIDIA, logotyp NVIDIA, CUDA oraz Tesla są znakami towarowymi lub zarejestrowanymi znakami towarowymi NVIDIA Corporation w Stanach Zjednoczonych i pozostałych krajach. Inne nazwy firm i produktów mogą być znakami towarowymi ich prawnych właścicieli. Funkcjonalność, ceny, dostępność i specyfikacje mogą ulec zmianie bez powiadomienia.

_____________________________________________________

1 Zespół badaczy uruchomił 10 symulacji dotyczących mutacji wirusa H1N1, które trwały ok. miesiąc w porównaniu do dwóch miesięcy w przypadku systemu składającego się z samych procesorów centralnych.
2 Źródło: CDC.gov: http://www.cdc.gov/h1n1flu/estimates_2009_h1n1.htm.