Nowości

Akceleratory graficzne NVIDIA umożliwiły dokonanie przełomu w badaniach nad wirusem HIV

Zespół z Uniwersytetu w Illinois stworzył nową metodę walki z HIV wykorzystując komputerową symulację wirusa na poziomie molekularnym

Product PR
Igor Stanek
Product PR Manager Notebooks/ION
EMEAI
NVIDIA Ltd
istanek@nvidia.com
+44 7775 940868
+42 0602 135136

Jacek Brol / Ewa Rudkowska
Gamma PR (NVIDIA PR)
nvidia@gammapr.pl
+48 (71) 3632947
+48 (71) 3632223

Tesla K20
Blue Waters Cray Supercomputer
HIV Capsule
HIV Capsule
Schulten

SANTA CLARA, Kalifornia — 29 maja 2013 r. — Naukowcy z Uniwersytetu Illinois w Urbana-Champaign (UIUC) osiągnęli ważny przełom w walce z ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV) dzięki wykorzystaniu akceleratorów graficznych NVIDIA® Tesla®, podała dzisiaj firma NVIDIA.

W artykule opublikowanym w najnowszym numerze Nature – najczęściej cytowanym magazynie naukowym na świecie – i wyróżnionym na jego okładce, opisano wyniki współpracy naukowców z UIUC oraz Szkoły Medycznej Uniwersytetu Pittsburskiego, którzy po raz pierwszy w historii określili precyzyjnie chemiczną strukturę kapsydu wirusa HIV, tj. białkowego płaszcza chroniącego jego materiał genetyczny. Poznanie tej struktury może być kluczowe do powstania nowych i skuteczniejszych leków antyretrowirusowych pomagających zwalczyć wirusa, który zabił już około 25 milionów osób, a kolejnych 34 milionów jest zarażonych.1

Naukowcy z UIUC poznali szczegóły struktury kapsydu dzięki pierwszej molekularnej symulacji wirusa HIV uruchomionej na Superkomputerze Blue Waters. Maszyna ta bazuje na platformie Cray XK7 i jest wyposażona w 3000 akceleratorów graficznych NVIDIA Tesla K20X – najwydajniejszych i najszybszych układów tego typu jakie kiedykolwiek powstały. Jego moc pozwoliła naukowcom na uruchomienie największej symulacji w historii badań naukowych, obejmującej aż 64 miliony molekuł.

„Przeprowadzenie symulacji tak ogromnej liczby molekuł bez mocy procesorów graficznych, w jakie wyposażono superkomputer Blue Waters, byłoby bardzo trudne”, powiedział Klaus Schulten, profesor fizyki na Uniwersytecie Illinois. „Zaczęliśmy wykorzystywać akceleratory graficzne do obliczeń pięć lat temu i od tego momentu tempo naszych badań znacząco wzrosło.”

Akceleratory graficzne NVIDIA Tesla zostały zaprojektowane z myślą o przyspieszeniu działania aplikacji naukowych i technicznych. Dzięki tym urządzeniom naukowcy z całego świata dokonali wielu przełomów w różnych dziedzinach nauki, dotyczących m.in. alternatywnych źródeł energii, astrofizyki, medycyny, badań nad klimatem i wielu innych. Superkomputery wyposażone w akceleratory graficzne zapewniają dużo wyższą wydajność i są bardziej energooszczędne od komputerów wyposażonych wyłacznie w procesory centralne.

„Dzięki procesorom graficznym naukowcy otrzymują moc, która pozwala im rozwiązywać problemy o szerszej skali i badać większe, bardziej złożone systemy”, powiedział Sumit Gupta, dyrektor generalny jednostki biznesowej ds. akceleratorów obliczeniowych Tesla w firmie NVIDIA. „Superkomputery Blue Waters i Titan – najszybszy superkomputer na świecie przeznaczony do otwartych badań naukowych, zainstalowany w Narodowym Laboratorium Oak Ridge – to jedynie dwa przykłady wielu systemów wyposażonych w akceleratory graficzne, dzięki którym powstają nowe odkrycia naukowe.”

Kapsyd kluczem do skuteczniejszych leków
Dzięki planowanemu zwiększeniu liczby akceleratorów graficznych w superkomputerze Blue Waters, naukowcy z UIUC planują wydłużenie czasu symulacji, aby uzyskać lepszy wgląd w strukturę oraz zachowanie kapsydu HIV.

Prace nad kapsydem stały się ważnym celem dla opracowania nowych leków antyretrowirusowych, szczególnie w świetle informacji, że małpy rezusy wykształciły odporność na wirusa HIV dzięki białku, które zakłóca działanie tego kapsydu.

Kapsyd to białkowa osłona wirusa, która zawiera jego materiał genetyczny. Chroni ona i „przemyca” ten materiał do ludzkich komórek. Po przedostaniu się do środka, materiał jest wypuszczany na zewnątrz. Tak rozpoczyna się infekcja.

Do tej pory nie utworzono jeszcze leków, których celem byłby kapsyd wirusa HIV. Jednak zdobyte informacje o strukturze kapsydu wirusa HIV dają farmakologom możliwośc stworzenia nowych i bardziej skutecznych leków zwalczających HIV.

O procesorach graficznych NVIDIA Tesla
Procesory graficzne NVIDIA Tesla to akceleratory oparte na platformie programistycznej NVIDIA CUDA®, przeznaczone do obliczeń równoległych. Układy Tesla zostały zaprojektowane od podstaw z myślą o obliczeniach wielkoskalowych oraz badań obliczeniowych i superkomputerach, zapewniając znacząco wyższy poziom akceleracji w wielu aplikacjach naukowych i komercyjnych od rozwiązań opartych na samych procesorach centralnych.

Aby dowiedzieć się więcej o platformie CUDA lub pobrać najnowszą wersję, odwiedź stronę internetową CUDA. Można także śledzić nas na Twitterze (@NVIDIATesla).

O firmie NVIDIA
Od 1993 roku NVIDIA (NASDAQ: NVDA) wiedzie prym w sztuce i rzemiośle tworzenia systemów obliczeń wizualnych. Technologie stworzone przez firmę przekształcają świat pełen wyświetlaczy w pełni interaktywne środowisko dla wszystkich użytkowników – od graczy po naukowców, od konsumentów po przedsiębiorstwa. Więcej informacji można znaleźć na stronach http://nvidianews.nvidia.com i http://blogs.nvidia.com.

Pewne oświadczenia przedstawione w tej informacji prasowej w tym wpływ i korzyści wynikające z zastosowania procesorów graficznych NVIDIA Tesla i akceleratorów graficznych NVIDIA Tesla oraz wpływy patentów firmy na nowoczesne komputery są oświadczeniami wybiegającymi w przyszłość i jako takie są obciążone ryzykiem i niepewnością, przez co stan faktyczny może znacząco różnić się od oczekiwań. Czynnikami mogącymi spowodować istotne zmiany przedstawionych wyników są m.in. globalna sytuacja ekonomiczna; wpływ zewnętrznych dostawców produkujących, montujących, pakujących i testujących produkty firmy NVIDIA; wpływ postępu technologicznego i konkurencji; odbiór produktów firmy NVIDIA i produktów jej partnerów przez rynek; wady konstrukcyjne, produkcyjne lub programowe; zmiany w zainteresowaniach i potrzebach klientów; zmiany standardów i interfejsów branżowych; nieoczekiwana utrata wydajności produktów lub technologii po zintegrowaniu ich w systemach; oraz inne czynniki ryzyka wyszczególniane w pewnych okresach czasu w raportach firmy NVIDIA przesyłanych do Securities and Exchange Commission (Komisja Papierów Wartościowych i Giełd), w tym w dokumencie Form 10-Q za okres finansowy zakończony 28 kwietnia 2013 r. Kopie dokumentów dostarczonych Komisji są dostępne bezpłatnie, w niezmienionej formie, na stronie internetowej firmy NVIDIA. Te wybiegające w przyszłość oświadczenia obowiązują tylko w chwili ich opublikowania, a z wyjątkiem przypadków przewidzianych przez prawo, firma NVIDIA nie podejmuje żadnych zobowiązań dotyczących aktualizacji tych wybiegających w przyszłość oświadczeń.

# # #

© 2013 NVIDIA Corporation. Wszelkie prawa zastrzeżone. NVIDIA, logotyp NVIDIA, Tesla oraz CUDA są znakami towarowymi lub zarejestrowanymi znakami towarowymi NVIDIA Corporation w Stanach Zjednoczonych i pozostałych krajach. Inne nazwy firm i produktów mogą być znakami towarowymi ich prawnych właścicieli. Funkcjonalność, ceny, dostępność i specyfikacje mogą ulec zmianie bez powiadomienia.

_________________________________________________

1 Źródło: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs360/en/index.html